在全站儀操作應注意理解全站儀的概念、了解工作原理、明確測量功能、熟悉操作步驟、合理設置儀器參數、正確選擇測量模式、掌握應用技術，這樣才能體現全站儀的特點及完整性和系統性，收到了較好使用效果。
(1)理解概念
(2)了解測量原理
全站儀的測量原理包括電子經緯儀測角、電子測距儀測距、電子補償器自動補償改正、電子計算機自動數據處理等。
(3)明確測量功能
全站儀是一個由測距儀、電子經緯儀、電子補償器、微處理機組合的整體。測量功能可分為基本測量功能和程序測量功能。只要開機，電子測角系統即開始工作并實時顯示觀測數據;其它測量功能只是測距及數據處理。
基本測量功能：包括電子測距、電子測角(水平角、垂直角);顯示的數據為觀測數據。
程序測量功能：包括水平距離和高差的切換顯示、三維坐標測量、對邊測量、放樣測量、偏心測量、后方交會測量、面積計算等;顯示的數據為觀測數據經處理后的計算數據。
(4)熟悉操作步驟
由于全站儀完全是按人們預置的作業程序及功能和參數設置進行工作的，所以必須按正確的操作步驟觀測，才能得到正確的觀測成果。
觀測前的三項準備：
1)安裝電池、對中整平(同光學經緯儀相同)、開機;
2)零設置(0 SET)：水平方向轉動儀器一周設置水平度盤零位、垂直方向轉動儀器一周設置垂直度盤零位;
3)選擇儀器功能：開機為基本測量功能，根據測量內容選擇儀器程序測量功能
觀測的三個步驟：
1)瞄準：準確瞄準目標棱鏡中心;
2)觀測：按儀器功能的操作步驟觀測(參照儀器說明書);
3)記錄：記錄或存儲觀測數據。
觀測結束的三個過程：檢查記錄、無誤后方可關機、搬站。
(5)合理設置儀器參數
儀器的各項改正是按設置儀器參數，經微處理器對原始觀測數據計算并改正后，顯示觀測數據和計算數據的。只有合理設置儀器參數，才能得到高精度的觀測成果。
(6)正確選擇測量模式
全站儀的測量模式很多，不同型號的儀器大同小異。由于受顯示屏的限制，常用的測量模式可以設置在三個不同的頁面上，一個頁面只能顯示四個測量模式。所有測量模式按相應的數學模型程序預置在儀器微處理器內，使用時必須按規定操作程序進行，否則會導致測量數據出現錯誤。
